Full Metal Panic! Invisible Victory vietsub có nội dung kể về Sousuke Sagara, một chuyên gia quân sự 17 tuổi làm việc cho các tổ chức bí mật Mithril, đã được chỉ định để bảo vệ mới nhất “Whispered” ứng cử viên Kaname Chidori. Để bảo vệ cho Chidori Kaname một cô gái có khả năng đặc biệt và dữ như lửa đó là nhiệm vụ không dễ dàng cho một người nào đó lớn lên trên chiến trường. Ngoài ra anime còn đề cập đến một thành viên của tổ chức Mithril, Sousuke Sagara, anh đã được giao nhiệm vụ bảo vệ một nữ sinh trung học, Chidori Kaname, từ những kẻ khủng bố và những người xấu khác.
